MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 395

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	TCT	2	6	39	44	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018659	CAGA	2	8	75	82	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018659	TGT	2	6	206	211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018659	GTG	2	6	213	218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018659	ATG	2	6	306	311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018659	GCC	2	6	345	350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018659	GCT	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018659	TTC	2	6	417	422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018659	CCG	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018659	CCGC	2	8	564	571	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_018659	TG	3	6	588	593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018659	GTA	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018659	CTG	2	6	670	675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018659	CAGG	2	8	688	695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018659	TCTG	2	8	729	736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018659	ACG	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018659	TCT	2	6	917	922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018659	TCA	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018659	GCCA	2	8	984	991	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018659	AG	3	6	1286	1291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018659	CTGT	2	8	1355	1362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018659	CAA	2	6	1396	1401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018659	AGG	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018659	T	7	7	1525	1531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018659	GAA	2	6	1558	1563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018659	CCT	2	6	2545	2550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018659	AT	3	6	3025	3030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018659	A	7	7	3051	3057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018659	A	6	6	11408	11413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018659	A	7	7	11419	11425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018659	CCG	2	6	11429	11434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018659	G	6	6	11451	11456	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018659	CCAGT	2	10	12059	12068	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_018659	GTG	2	6	12072	12077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018659	TGG	2	6	12086	12091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018659	ACC	2	6	12096	12101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018659	ATG	2	6	12203	12208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018659	GTT	2	6	12227	12232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018659	ACAG	2	8	14804	14811	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018659	GAT	2	6	14812	14817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018659	GTTT	2	8	14818	14825	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018659	AAAT	2	8	14848	14855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018659	ATT	2	6	14899	14904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018659	CTGG	2	8	14912	14919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018659	GTC	2	6	14927	14932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018659	ATG	2	6	14986	14991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018659	CGA	2	6	14999	15004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018659	AAC	2	6	17026	17031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018659	T	6	6	17055	17060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018659	TCC	2	6	17909	17914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018659	T	6	6	17961	17966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018659	AAT	2	6	17978	17983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018659	GTT	2	6	18015	18020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018659	ATG	2	6	18049	18054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018659	A	6	6	19229	19234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018659	CAA	2	6	19241	19246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018659	GTA	2	6	19297	19302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018659	CAGT	2	8	19364	19371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018659	ATG	2	6	19447	19452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018659	ATG	2	6	19480	19485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018659	GTC	2	6	19542	19547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018659	GCT	2	6	19578	19583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018659	CGGT	2	8	19600	19607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018659	TAA	2	6	19618	19623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018659	AATT	2	8	19624	19631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018659	ATC	2	6	19654	19659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018659	CGG	2	6	19681	19686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018659	GTG	2	6	19692	19697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018659	TGA	2	6	19780	19785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018659	TTAA	2	8	19815	19822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018659	CCA	2	6	19865	19870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018659	GTT	2	6	19912	19917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018659	ACC	2	6	19942	19947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018659	TGT	2	6	20025	20030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018659	TGAAT	2	10	20043	20052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018659	ATC	3	9	20113	20121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018659	AC	3	6	20169	20174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018659	CCA	2	6	20681	20686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018659	ACT	2	6	20750	20755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018659	CAG	2	6	20774	20779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018659	CGT	2	6	20825	20830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018659	GT	3	6	20829	20834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018659	ATCAC	2	10	26762	26771	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_018659	AT	3	6	30184	30189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018659	TA	3	6	31719	31724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018659	GTTA	2	8	31732	31739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018659	TAAG	2	8	31750	31757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018659	ATT	2	6	31763	31768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018659	GA	3	6	31805	31810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018659	TTG	2	6	31868	31873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018659	ATT	2	6	31886	31891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018659	T	6	6	31969	31974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018659	T	6	6	32024	32029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018659	TGGTG	2	10	32033	32042	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018659	GAC	2	6	32061	32066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018659	TCCG	2	8	32073	32080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018659	AT	3	6	32115	32120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018659	TAA	2	6	32168	32173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018659	TTTA	2	8	32214	32221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018659	TCA	2	6	32263	32268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018659	TTA	2	6	32269	32274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018659	GT	3	6	32336	32341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018659	TCT	2	6	32387	32392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018659	AAG	2	6	32436	32441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018659	AGT	2	6	32455	32460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018659	ACC	2	6	32479	32484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018659	TTA	2	6	32608	32613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018659	AGGC	2	8	32630	32637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018659	AGG	2	6	32656	32661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018659	A	7	7	32686	32692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018659	ATC	2	6	32704	32709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018659	AC	3	6	32710	32715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018659	A	6	6	33066	33071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018659	AGT	2	6	33083	33088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018659	AGAA	2	8	33092	33099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018659	AGA	2	6	33881	33886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018659	TC	3	6	33898	33903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018659	GGCC	2	8	33923	33930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018659	TTTC	2	8	33971	33978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018659	TGG	2	6	34024	34029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018659	TTGAA	2	10	34067	34076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018659	A	6	6	34075	34080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018659	GCCCG	2	10	34081	34090	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_018659	ATG	2	6	34673	34678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018659	CAG	2	6	34776	34781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018659	AT	3	6	34920	34925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018659	AAT	2	6	34945	34950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018659	TTA	2	6	34977	34982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018659	GTTTAT	2	12	35001	35012	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018659	GAA	2	6	35568	35573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018659	CGA	2	6	35588	35593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018659	A	6	6	35683	35688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018659	A	6	6	35694	35699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018659	ATG	2	6	35739	35744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018659	TGT	2	6	35861	35866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018659	TAT	2	6	35900	35905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018659	T	6	6	35948	35953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018659	T	6	6	35959	35964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018659	ATT	2	6	35993	35998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018659	AAG	2	6	36065	36070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018659	ATTTT	2	10	36105	36114	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018659	T	7	7	36111	36117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018659	GAG	2	6	36154	36159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018659	GAAGA	2	10	36166	36175	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018659	TTA	2	6	36226	36231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018659	GCG	2	6	36264	36269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018659	GA	3	6	36306	36311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018659	AGA	2	6	36334	36339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_018659	TCA	2	6	37695	37700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.